研究所专家认为：和早期胚胎冻存相比，未受精卵母细胞冻存涉及更多技术的问题，但是伦理和法律纠纷较少；进一步的，她使得妇女有可能在盘腔疾病、手术和放射化疗破坏卵巢后，保留有生殖能力

冷冻过程中对卵母细胞可能产生的伤害有，透明带改变，可能会变硬，降低受孕率；皮质颗粒的可能改变、可能被永久释放，增加多精入卵的风险；减数分裂纺锤体的可能改变，可能会增加非整数倍的风险；由于胞内冰晶形成导致卵质细胞器的改变；以及由于胞内和胞外溶液渗透压不同导致的卵母细胞体质改变。

和卵母细胞冻存相关的最重要的风险是通过这种方法得到的胚胎的非整倍性。事实上，卵母细胞减数分裂纺锤体可在低温下解聚，且即使在加热后发生重聚，在卵母细胞第二次减数分裂的间期仍然会发生基因异常，可导致胚胎非整倍性，并在受精时完成分裂。纺锤体解聚的实质取决于温度下降的程度以及持续的时间，抗冻剂本身也会增加纺锤体结构的变化。

评估非整倍体风险的重要因素是母体年龄，因为在40岁的妇女中，减数分裂纺锤体常常会出现异常，这些妇女中出现染色体异常和前分裂更多。